Rak tarczycy - raport synoptyczny

fraza_nie_okreslono = "Nie określono."
 fraza_pusta = ""
 
 thyroid_tumors = {
   const data = await FileAttachment("histological_types.json").json();
   return data;
 }

function typ_histo_opis(typ_histo, typ_histo_komentarz) {
  var opis = "Typ histologiczny: ";
  
  if(typ_histo)
  {
    opis += ` ${typ_histo.type}` ;
    opis += typ_histo.subtype ? `, ${typ_histo.subtype}` : ""
    opis += typ_histo.ICD_O ? `, ICD-O ${typ_histo.ICD_O}` : ""
  } else {
    opis += fraza_nie_okreslono
  }
  
  if(typ_histo_komentarz)
  {
    opis += "\nTyp histologiczny - komentarz: " + typ_histo_komentarz;
  } 
  
  return opis;
  
}

function ilosc_ognisk_opis(ilosc_ognisk) {
  let opis = "Liczba ognisk: ";

  opis += ilosc_ognisk.status ? ilosc_ognisk.status + "." : fraza_nie_okreslono;

  opis += ilosc_ognisk.komentarz
    ? "\nLiczba ognisk - komentarz: " + ilosc_ognisk.komentarz
    : fraza_pusta;

  return opis;
}

function lokalizacja_opis(lokalizacja) {
  let opis = "Lokalizacja: ";

  opis += lokalizacja.status.length
    ? lokalizacja.status.length > 1
      ? lokalizacja.status.join(", ") + ". "
      : lokalizacja.status + ". "
    : fraza_nie_okreslono;

  opis += lokalizacja.komentarz
    ? "\nLokalizacja - komentarz: " + lokalizacja.komentarz
    : fraza_pusta;

  return opis;
}

function wielkosc_opis(wielkosc) {
  let opis = "Wymiar największego ogniska: ";

  opis += wielkosc.ile_mm ? wielkosc.ile_mm + " mm. " : fraza_nie_okreslono;

  opis += wielkosc.komentarz
    ? "\nWymiar największego ogniska - komentarz: " + wielkosc.komentarz
    : fraza_pusta;

  return opis;
}

function aktywnosc_mitotyczna_opis(aktywnosc_mitotyczna) {
  let opis = "Aktywność mitotyczna: ";

  opis += aktywnosc_mitotyczna.status
    ? aktywnosc_mitotyczna.status + ". "
    : fraza_nie_okreslono;

  opis += aktywnosc_mitotyczna.komentarz
    ? "\nAktywność mitotyczna - komentarz: " + aktywnosc_mitotyczna.komentarz
    : fraza_pusta;

  return opis;
}

function typ_wzrostu_opis(typ_wzrostu) {
  let opis = "Typ wzrostu: ";

  opis += typ_wzrostu.rodzaj ? typ_wzrostu.rodzaj + ". " : fraza_nie_okreslono;

  opis += typ_wzrostu.komentarz
    ? "\nTyp wzrostu - komentarz: " + typ_wzrostu.komentarz
    : fraza_pusta;

  return opis;
}

function naciekanie_torebki_opis(naciekanie_torebki) {
  let opis = "Naciekanie torebki guza: ";

  opis += naciekanie_torebki.status
    ? naciekanie_torebki.status + ". "
    : fraza_nie_okreslono;

  opis += naciekanie_torebki.komentarz
    ? "\nNaciekanie torebki guza - komentarz: " + naciekanie_torebki.komentarz
    : fraza_pusta;

  return opis;
}

function naciekanie_naczyn_opis(naciekanie_naczyn) {
  let opis = "Naciekanie naczyń limfatycznych: ";

  opis += naciekanie_naczyn.status_l
    ? naciekanie_naczyn.status_l + ". "
    : fraza_nie_okreslono;

  opis += "\nNaciekanie naczyń krwionośnych: ";

  opis += naciekanie_naczyn.status_v
    ? naciekanie_naczyn.status_v + ". "
    : fraza_nie_okreslono;

  opis += "\nNaciekanie naczyń - liczba ognisk: ";

  opis += naciekanie_naczyn.ile_ognisk
    ? naciekanie_naczyn.ile_ognisk + ". "
    : fraza_nie_okreslono;

  opis += naciekanie_naczyn.komentarz
    ? "\nNaciekanie naczyń - komentarz: " + naciekanie_naczyn.komentarz
    : fraza_pusta;

  return opis;
}

function martwica_opis(martwica) {
  const opis = martwica == "" ? fraza_nie_okreslono : martwica + ".";

  return `Martwica: ${opis}`;
}

function naciekanie_pozatarczycowe_opis(naciekanie_pozatarczycowe) {
  let opis = "Naciekanie pozatarczycowe: ";

  if (
    naciekanie_pozatarczycowe.nie_stwierdzono == null &&
    naciekanie_pozatarczycowe.stwierdzono.length === 0
  )
    opis += fraza_nie_okreslono;
  else {
    opis +=
      naciekanie_pozatarczycowe.stwierdzono.length > 0
        ? [].concat(...naciekanie_pozatarczycowe.stwierdzono) + ". "
        : naciekanie_pozatarczycowe.nie_stwierdzono
        ? naciekanie_pozatarczycowe.nie_stwierdzono + ". "
        : fraza_pusta;
  }

  opis += naciekanie_pozatarczycowe.komentarz
    ? "\nNaciekanie pozatarczycowe - komentarz: " +
      naciekanie_pozatarczycowe.komentarz
    : fraza_pusta;

  return opis;
}

function marginesy_opis(marginesy) {
  let opis = "Powierzchnia operacyjna: ";

  opis += marginesy.status ? marginesy.status + ". " : fraza_nie_okreslono;

  opis += marginesy.odleglosc
    ? "\nSzerokość najwęższego marginesu: " +
      marginesy.odleglosc +
      " (mm). "
    : fraza_pusta;

  opis += marginesy.komentarz
    ? "\nPowierzchnia operacyjna - komentarz: " + marginesy.komentarz
    : fraza_pusta;

  return opis;
}

function wezly_chlonne_opis(wezly_chlonne) {

  let opis =  "Ilość zidentyfikowanych węzłów chłonnych: "
  
  if ( wezly_chlonne.ilosc_wezlow != "" )
  {
    opis += wezly_chlonne.ilosc_wezlow + ". "
    if ( wezly_chlonne.ilosc_wezlow != "0")
    {
      opis += "\nIlość przerzutowych węzłów chłonnych: " 
      opis += wezly_chlonne.ilosc_przerzutowych === "" ? 
        "Nie określono. " 
        : wezly_chlonne.ilosc_przerzutowych + ". "

      opis += "\nLokalizacja przerzutowych węzłów chłonnych (grupy węzłowe): "
      opis += wezly_chlonne.lokalizacja_przerzutowych === "" ? 
        "Nie określono. " 
        : wezly_chlonne.lokalizacja_przerzutowych + ". "

      opis += "\nWielkość największego przerzutowego węzła (mm): "
      opis += wezly_chlonne.najw_wymiar_najw_wezla === "" ? 
        "Nie określono. " 
        : wezly_chlonne.najw_wymiar_najw_wezla + ". "

      opis += "\nWielkość największego ogniska przerzutowego (mm): "
      opis += wezly_chlonne.najw_wymiar_ogniska_przerzutowego === "" ? 
        "Nie określono. " 
        : wezly_chlonne.najw_wymiar_ogniska_przerzutowego + ". "

      opis += "\nPrzekraczanie torebki węzła przez przerzuty: "
      opis += wezly_chlonne.naciekanie_pozawezlowe === null ? 
        "Nie określono. " 
        : wezly_chlonne.naciekanie_pozawezlowe + ". "
    }   
  }
  else opis += fraza_nie_okreslono
  
  return opis
}

function przytarczyce_opis(przytarczyce) {
  let opis = "Ilość zidentyfikowanych przytarczyc: ";

  opis += przytarczyce.ilosc != "" ? przytarczyce.ilosc : fraza_nie_okreslono;

  return opis;
}

function dodatkowe_opis(dodatkowe) {
 
  let opis =  "Dodatkowe rozpoznania: "
  
  if ( dodatkowe.rozpoznanie.length > 0 || dodatkowe.opis_slowny != ""  )
  {
    opis +=  [].concat(...dodatkowe.rozpoznanie) 
    opis += dodatkowe.rozpoznanie.length > 0 ? ". " : ""
    opis += dodatkowe.opis_slowny
  } 
  else if (dodatkowe.status)
    opis += dodatkowe.status + ". "
  else 
    opis += fraza_nie_okreslono
  
  return opis
}

function tnm_kod(str) {
  return str ? str.split(" -")[0] : "";
}

function tnm_opis(tnm) {
  let opis = "Zaawansowanie wg klasyfikacji TNM-8: ";

  if (tnm.pT || tnm.pN) {
    opis += "p" + tnm_kod(tnm.pT);
    opis +=
      tnm.descriptors.length > 0
        ? "(" + tnm.descriptors.map(tnm_kod) + ")"
        : "";
    opis += tnm_kod(tnm.pN);
  } else opis += fraza_nie_okreslono;

  if (tnm.opis_slowny != "")
    opis += "\nZaawansowanie wg klasyfikacji TNM-8 - komentarz: " + tnm.opis_slowny;

  return opis;
}

function immunohistochemia_opis(immunohistochemia) {
  let opis = "Immunohistochemia i histochemia: ";

  opis += immunohistochemia.status ? immunohistochemia.status + ". " : fraza_nie_okreslono;

  opis += immunohistochemia.opis
    ? "\nImmunohistochemia i histochemia - opis: " + immunohistochemia.opis 
    : fraza_pusta;

  return opis;
}

function generuj_caly_opis() {
  let caly_opis = "";
  caly_opis += typ_histo_opis(typ_histo, typ_histo_komentarz) + "\n";
  caly_opis += ilosc_ognisk_opis(ilosc_ognisk) + "\n";
  caly_opis += lokalizacja_opis(lokalizacja) + "\n";
  caly_opis += wielkosc_opis(wielkosc) + "\n";
  caly_opis += aktywnosc_mitotyczna_opis(aktywnosc_mitotyczna) + "\n";
  caly_opis += typ_wzrostu_opis(typ_wzrostu) + "\n";
  caly_opis += naciekanie_torebki_opis(naciekanie_torebki) + "\n";
  caly_opis += naciekanie_naczyn_opis(naciekanie_naczyn) + "\n";
  caly_opis += martwica_opis(martwica) + "\n";
  caly_opis += naciekanie_pozatarczycowe_opis(naciekanie_pozatarczycowe) + "\n";
  caly_opis += marginesy_opis(marginesy) + "\n";
  caly_opis += wezly_chlonne_opis(wezly_chlonne) + "\n";
  caly_opis += przytarczyce_opis(przytarczyce) + "\n";
  caly_opis += dodatkowe_opis(dodatkowe) + "\n";
  caly_opis += immunohistochemia_opis(immunohistochemia) + "\n";
  caly_opis += tnm_opis(tnm) + "\n";
  return caly_opis;
}

Opis mikroskopowy

Typ histologiczny wg WHO 2022

viewof typ_histo_search = Inputs.search(thyroid_tumors, {
    label: "Typ histologiczny:"
})

html`<br />`

viewof typ_histo = Inputs.table(typ_histo_search, {
  columns: [
    "type", "subtype"
  ],
  multiple: false
})

md`<br/><sup>[Źródło](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9633223/)</sup>`

viewof typ_histo_komentarz = Inputs.textarea({
    label: "Komentarz",
    placeholder: "opcjonalny",
  })

typ_histo_opis(typ_histo, typ_histo_komentarz)

Liczba ognisk

viewof ilosc_ognisk = Inputs.form({
  status: Inputs.radio(
    ["Jednoogniskowy", "Wieloogniskowy", "Nie można ocenić"],
    { label: "Liczba ognisk:" }
  ),

  komentarz: Inputs.textarea({
    label: "Komentarz",
    placeholder: "opcjonalny, np. liczba ognisk",
  }),
});

ilosc_ognisk_opis(ilosc_ognisk);

Lokalizacja

md`**Uwaga:** Dotyczy ogniska najbardziej istotnego klinicznie. Zaznacz wszystkie zajęte struktury.`

viewof lokalizacja = Inputs.form({
  status: Inputs.checkbox(
    [
      "Lewy płat",
      "Prawy płat",
      "Cieśń",
      "Płat piramidowy",
      "Inne",
      "Nie można ocenić",
    ],
    { label: "Lokalizacja", description: "Wybierz" }
  ),

  komentarz: Inputs.textarea({
    label: "Komentarz",
    placeholder: "opcjonalny",
  }),
});

lokalizacja_opis(lokalizacja);

Wymiary

md`**Uwaga:** Dotyczy największego ogniska.`

viewof wielkosc = Inputs.form({
  ile_mm: Inputs.text({
    label: "Największy wymiar (mm)",
    placeholder: "mm",
  }),

  komentarz: Inputs.textarea({
    label: "Komentarz",
    placeholder: "opcjonalny",
  }),
});

wielkosc_opis(wielkosc);

Aktywność mitotyczna

md`**Uwaga** Kryterium **3** mitoz/mm<sup>2</sup> dotyczy *high-grade follicular cell-derived non-anaplastic thyroid carcinoma*, natomiast kryterium **5** mitoz/mm<sup>2</sup> dotyczy *differentiated high grade thyroid carcinoma*.`

viewof aktywnosc_mitotyczna = Inputs.form({
  status: Inputs.radio(
    [
      "<3 mitozy/mm2",
      "≥3 mitozy/mm2",
      "<5 mitoz/mm2",
      "≥5 mitoz/mm2",
      "Nie można ocenić",
    ],
    { label: "Liczba mitoz w `hot spot`:" }
  ),

  komentarz: Inputs.text({
    label: "Komentarz",
    placeholder: "opcjonalny",
  }),
});

aktywnosc_mitotyczna_opis(aktywnosc_mitotyczna);

Typ wzrostu

viewof typ_wzrostu = Inputs.form({
  rodzaj: Inputs.radio(["Otorebkowany", "Naciekający", "Inny"], {
    label: "Typ wzrostu:",
  }),

  komentarz: Inputs.text({
    label: "Komentarz",
    placeholder: "opcjonalny",
  }),
});

typ_wzrostu_opis(typ_wzrostu);

Naciekanie torebki guza

viewof naciekanie_torebki = Inputs.form({
  status: Inputs.radio(
    [
      "Nie dotyczy",
      "Nie stwierdzono",
      "Wątpliwe",
      "Obecne",
      "Nie można ocenić",
    ],
    { label: "Naciekanie torebki guza:" }
  ),

  komentarz: Inputs.text({
    label: "Komentarz",
    placeholder: "opcjonalny",
  }),
});

naciekanie_torebki_opis(naciekanie_torebki);

Naciekanie naczyń

viewof naciekanie_naczyn = Inputs.form({
  status_l: Inputs.radio(["Nie stwierdzono", "Obecne", "Nie można ocenić"], {
    label: "Naciekanie nacz. limfatycznych:",
  }),

  status_v: Inputs.radio(["Nie stwierdzono", "Obecne", "Nie można ocenić"], {
    label: "Naciekanie nacz. krwionośnych:",
  }),

  ile_ognisk: Inputs.radio(
    ["Nie dotyczy", "< 4 ogniska", "4 lub więcej ognisk"],
    {
      label: "j/w, liczba ognisk, jeśli guz otorebkowany",
    }
  ),

  komentarz: Inputs.textarea({
    label: "Komentarz",
    placeholder: "opcjonalny",
  }),
});

naciekanie_naczyn_opis(naciekanie_naczyn);

Martwica

viewof martwica = Inputs.form([
  Inputs.radio(["Nie stwierdzono", "Obecna"], {
    label: "Martwica:",
  }),
]);

martwica_opis(martwica);

Naciekanie pozatarczycowe

viewof naciekanie_pozatarczycowe = Inputs.form({
  nie_stwierdzono: Inputs.radio(["Nie stwierdzono", "Nie można ocenić"], {
    label: "Naciekanie pozatarczycowe",
  }),

  stwierdzono: Inputs.checkbox(
    [
      "naciekanie okołotarczycowej tkanki włóknistotłuszczowej",
      "naciekanie mięśni szkieletowych",
      "naciekanie tkanki podskórnej, krtani, tchawicy, przełyku lub nerwu krtaniowego wstecznego",
      "naciekanie powięzi przedkręgowej lub otaczający tętnicę szyjną lub naczynia śródpiersiowe",
    ],
    {
      label: "Wybierz, jeśli obecne",
    }
  ),

  komentarz: Inputs.textarea({
    label: "Komentarz",
    placeholder: "opcjonalny",
  }),
});

naciekanie_pozatarczycowe_opis(naciekanie_pozatarczycowe);

Powierzchnia operacyjna

viewof marginesy = Inputs.form({
  status: Inputs.radio(["Nie zajęta (R0)", "Zajęta w bad. mikroskopowym (R1)", "Zajęta w bad. makroskopowym (R2)", "Nie można ocenić"], {
    label: "Powierzchnia operacyjna:",
  }),

  odleglosc: Inputs.text({
    label: "Szerokość najwęższego marginesu (mm)",
    placeholder: "mm",
  }),

  komentarz: Inputs.textarea({
    label: "Komentarz",
    placeholder: "opcjonalny, np. która powierzchnia jest zajęta przez nowotwór, inne",
  }),
});

marginesy_opis(marginesy);

Węzły chłonne

viewof wezly_chlonne = Inputs.form({
  ilosc_wezlow: Inputs.text({
    label: "Ilość zidentyfikowanych węzłów chłonnych:",
    placeholder: "wpisz 0, jeśli nie stwierdzono",
  }),

  ilosc_przerzutowych: Inputs.text({
    label: "Ilość przerzutowych węzłów chłonnych:",
    placeholder: "wpisz 0, jeśli nie stwierdzono",
  }),

  lokalizacja_przerzutowych: Inputs.textarea({
    label: "Lokalizacja przerzutowych węzłów chłonnych (grupy węzłowe)",
    placeholder: "opisz",
  }),

  najw_wymiar_najw_wezla: Inputs.text({
    label: "Wielkość największego przerzutowego węzła (mm):",
    placeholder: "mm",
  }),

  najw_wymiar_ogniska_przerzutowego: Inputs.text({
    label: "Wielkość największego ogniska przerzutowego (mm):",
    placeholder: "mm",
  }),

  naciekanie_pozawezlowe: Inputs.radio(
    ["Nie stwierdzono", "Obecne", "Nie można ocenić"],
    { label: "Przekraczanie torebki węzła przez przerzuty" }
  ),
});

wezly_chlonne_opis(wezly_chlonne)

Przytarczyce

viewof przytarczyce = Inputs.form({
  ilosc: Inputs.text({
    label: "Ilość zidentyfikowanych przytarczyc:",
    placeholder: "wpisz 0, jeśli nie stwierdzono",
  }),
});

przytarczyce_opis(przytarczyce);

Dodatkowe rozpoznania

viewof dodatkowe = Inputs.form({

  status: Inputs.radio(["Nie stwierdzono"], { label: "Dodatkowe patologie" }),

  rozpoznanie: Inputs.checkbox(
    [
      "Guzek hiperplastyczny",
      "Guzkowa choroba pęcherzykowa tarczycy (thyroid follicular nodular disease)",
      "Zapalenie limfocytowe",
      "Gruczolak pęcherzykowy",
      "Gruczolak onkocytowy"
    ],
    { label: "Wybierz, jeśli obecne" }
  ),

  opis_slowny: Inputs.textarea({
    label: "Inne",
    placeholder: "",
  }),
});

dodatkowe_opis(dodatkowe)

Immunohistochemia

viewof immunohistochemia = Inputs.form({
  status: Inputs.radio(["Nie wykonywano", "Wykonywano"], {
    label: "Immunohistochemia i histochemia:",
  }),

  opis: Inputs.textarea({
    label: "Opis",
    placeholder: "",
  }),
});

immunohistochemia_opis(immunohistochemia);

Zaawansowanie wg klasyfikacji TNM

md`**AJCC TNM 8<sup>th</sup> edition**`

viewof tnm = Inputs.form({
  descriptors: Inputs.checkbox(
    ["s - solitary tumour", "m - multifocal tumor"],
    { label: "Liczba ognisk" }
  ),

  pT: Inputs.radio(
    [
      "TX - Primary tumour cannot be assessed",
      "T0 - No evidence of primary tumour",
      "T1a - Tumour ≤1 cm in greatest dimension limited to the thyroid",
      "T1b - Tumour >1 cm but ≤2 cm in greatest dimension, limited to the thyroid",
      "T2 - Tumour >2 cm but ≤4 cm in greatest dimension limited to the thyroid",
      "T3a - Tumour >4 cm limited to the thyroid",
      "T3b - Gross extrathyroidal extension invading only strap muscles (sternohyoid, sternothyroid, thyrohyoid, or omohyoid muscles) from a tumour of any size",
      "T4a - Gross extrathyroidal extension invading subcutaneous soft tissues, larynx, trachea, oesophagus, or recurrent laryngeal nerve from a tumour of any size",
      "T4b - Gross extrathyroidal extension invading prevertebral fascia or encasing the carotid artery or mediastinal vessels from a tumour of any size",
    ],
    { label: "Primary tumor" }
  ),

  pN: Inputs.radio(
    [
      "NX - Regional lymph nodes cannot be assessed",
      "N0 - No evidence of regional lymph node metastasis",
      "N0a - One or more cytological or histologically confirmed benign lymph node",
      "N0b - No radiologic or clinical evidence of locoregional lymph node metastasis",
      "N1a - Metastasis to level VI or VII (pretracheal, paratracheal, or prelaryngeal/Delphian or upper mediastinal) lymph nodes. This can be unilateral or bilateral disease.",
      "N1b - Metastasis to unilateral, bilateral or contralateral lateral neck lymph nodes (levels I, II, III, IV or V) or retropharyngeal lymph nodes",
    ],
    { label: "Regional lymph nodes (pN)" }
  ),

  opis_slowny: Inputs.textarea({
    label: "komentarz",
    placeholder: "opcjonalne",
  }),
});

tnm_opis(tnm);

Pobierz opis badania

htl.html`<p><strong>Poniższy opis należy w skopiować i wkleić do CliniNET.</strong></p>`

caly_opis_tekst = generuj_caly_opis();

viewof caly_opis = Inputs.textarea({
  value: caly_opis_tekst,
  rows: 40,
  label: "Opis badania:",
});

htl.html`<br>`

Inputs.button("kopiuj opis do schowka", {label: " ", value: null, reduce: () => navigator.clipboard.writeText(caly_opis_tekst)})